Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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