Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm6863-201ENSMUST00000052882 636 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr224-201ENSMUST00000081102 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Dph5-201ENSMUST00000043342 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Nin-211ENSMUST00000222237 9919 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Svil-210ENSMUST00000140448 7423 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Spata1-202ENSMUST00000093951 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Mpdz-216ENSMUST00000220807 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Mycbp2-201ENSMUST00000159855 15233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Tma16-201ENSMUST00000026681 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Lpin1-207ENSMUST00000222989 4103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Ncoa6-202ENSMUST00000109669 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Kcnma1-224ENSMUST00000224077 3537 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Cacna1c-207ENSMUST00000186889 13162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Fer1l6-203ENSMUST00000161028 5714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Ptpn13-201ENSMUST00000048957 7915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm38147-201ENSMUST00000192397 1798 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Abca1-201ENSMUST00000030010 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Ppp1r3b-202ENSMUST00000210337 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Rtel1-203ENSMUST00000098971 4307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Znfx1-202ENSMUST00000067584 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Sbno1-216ENSMUST00000199808 10161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Uqcrq-202ENSMUST00000109019 504 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm23533-201ENSMUST00000157540 245 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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