Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pou5f1P20263 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms