Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Mir7029-201ENSMUST00000184777 61 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Ncoa6-202ENSMUST00000109669 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm39090-201ENSMUST00000205284 972 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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