Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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H2-M1F7CXU4 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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H2-M1F7CXU4 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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