Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 1700125H03Rik-202ENSMUST00000139265 637 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm371-201ENSMUST00000142240 1245 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Rpl29-203ENSMUST00000150576 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Scarna17-201ENSMUST00000158064 79 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm22424-201ENSMUST00000158527 87 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm22670-201ENSMUST00000158724 143 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm5300-201ENSMUST00000182201 1003 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm29143-201ENSMUST00000189462 201 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm553-201ENSMUST00000189527 701 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm43840-201ENSMUST00000199444 484 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Ifna4-201ENSMUST00000094973 561 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Dram2-203ENSMUST00000121034 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Cav1-202ENSMUST00000115453 2746 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 4930456G14Rik-201ENSMUST00000193054 1330 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm23484-201ENSMUST00000104178 131 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm15251-201ENSMUST00000177947 883 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 9330159M07Rik-204ENSMUST00000188156 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 AC154307.1-201ENSMUST00000214799 90 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm35035-201ENSMUST00000218838 628 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm18629-201ENSMUST00000222496 884 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Trex1-201ENSMUST00000061973 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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