Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Mir486-201ENSMUST00000093576 128 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Psg-ps1-201ENSMUST00000165490 1574 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Ctps2-201ENSMUST00000033727 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Sema3d-205ENSMUST00000197927 3207 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 BC049715-203ENSMUST00000203499 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm46430-207ENSMUST00000222254 1703 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Olfr1058-201ENSMUST00000102631 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm23131-201ENSMUST00000104253 132 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Blvrb-203ENSMUST00000108358 951 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Trim39Q9ESN2 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm12006-201ENSMUST00000120786 403 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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Trim39Q9ESN2 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm12265-201ENSMUST00000139025 468 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 1700025N21Rik-201ENSMUST00000160997 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Trim39Q9ESN2 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Trim39Q9ESN2 AC124585.1-201ENSMUST00000213334 953 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 AC163660.3-202ENSMUST00000224917 464 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 AC207128.1-201ENSMUST00000225928 799 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Cox8c-201ENSMUST00000053611 458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Olfr419-201ENSMUST00000061990 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm4871-201ENSMUST00000071421 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 2310069B03Rik-202ENSMUST00000186147 1833 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm28720-201ENSMUST00000190728 3156 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Psg19-201ENSMUST00000004657 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm35722-201ENSMUST00000218270 1625 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Cav1-202ENSMUST00000115453 2746 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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