Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm38661-201ENSMUST00000216555 5814 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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