Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Rnft1Q9DCN7 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Rnft1Q9DCN7 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Rnft1Q9DCN7 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Rnft1Q9DCN7 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Rnft1Q9DCN7 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Rnft1Q9DCN7 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Rnft1Q9DCN7 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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Rnft1Q9DCN7 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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Rnft1Q9DCN7 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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Rnft1Q9DCN7 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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