Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pkp2Q9CQ73 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp2Q9CQ73 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms