Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm6054-201ENSMUST00000078052 378 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Wfdc10-201ENSMUST00000094344 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm12459-201ENSMUST00000120659 356 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm25770-201ENSMUST00000158566 115 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm5586-201ENSMUST00000206264 795 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms