Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Yes1-202ENSMUST00000168707 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Cep170-215ENSMUST00000195717 6967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef9-209ENSMUST00000181987 6222 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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