Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Mir3104-201ENSMUST00000174911 63 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Nwd1-204ENSMUST00000161254 10792 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Hpgds-201ENSMUST00000031982 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm14252-201ENSMUST00000131801 3215 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Dclk1-201ENSMUST00000054237 7847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Rapgef5-206ENSMUST00000222185 5508 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Retreg1-203ENSMUST00000226438 2783 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Sptan1-201ENSMUST00000046257 7820 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Prpf8-202ENSMUST00000102510 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Cfap44-202ENSMUST00000120049 6199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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