Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 216.8 ms