Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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Rpusd3Q14AI6 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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Rpusd3Q14AI6 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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Rpusd3Q14AI6 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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Rpusd3Q14AI6 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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Rpusd3Q14AI6 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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Rpusd3Q14AI6 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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Rpusd3Q14AI6 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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Rpusd3Q14AI6 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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Rpusd3Q14AI6 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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Rpusd3Q14AI6 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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Rpusd3Q14AI6 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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Rpusd3Q14AI6 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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Rpusd3Q14AI6 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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