Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Usp54-202ENSMUST00000035340 6495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Aldh1l2-201ENSMUST00000020497 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Peak1-201ENSMUST00000061552 6996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms