Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms