Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Srcap-214ENSMUST00000190390 9633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc13P50207 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms