Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm19872-201ENSMUST00000183446 687 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Mir6415-201ENSMUST00000184064 100 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm29477-201ENSMUST00000189860 499 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 P2ry14-205ENSMUST00000197220 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm7879-202ENSMUST00000200338 635 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm16273-201ENSMUST00000202238 268 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm33926-201ENSMUST00000208755 357 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm45299-201ENSMUST00000210199 420 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm32842-201ENSMUST00000212653 738 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm34006-201ENSMUST00000213985 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC160112.1-201ENSMUST00000219139 714 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 A930040O22Rik-201ENSMUST00000221662 973 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC132237.2-201ENSMUST00000221702 1209 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Pecam1-201ENSMUST00000068021 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm21541-201ENSMUST00000098128 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
VdrP48281 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Anxa9-201ENSMUST00000015846 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Mrps18c-202ENSMUST00000112898 460 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm8802-201ENSMUST00000118633 740 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm13471-201ENSMUST00000122057 433 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Tmsb10-204ENSMUST00000144337 433 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm15866-201ENSMUST00000149048 785 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm26407-201ENSMUST00000158504 307 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Krr1-204ENSMUST00000174653 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm21886-201ENSMUST00000178391 645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm27197-201ENSMUST00000184325 479 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm37247-201ENSMUST00000192549 730 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm43647-201ENSMUST00000198142 486 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm42952-206ENSMUST00000199324 506 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Ndufa4-203ENSMUST00000204084 409 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm45155-201ENSMUST00000207365 596 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Olfr1498-ps1-201ENSMUST00000208721 991 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Ldhc-204ENSMUST00000210585 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 AC107452.2-201ENSMUST00000228415 363 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 CT009550.3-201ENSMUST00000228542 455 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Cutal-202ENSMUST00000047447 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Olfr51-201ENSMUST00000076514 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms