Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Olfr165-203ENSMUST00000206410 1040 ntAPPRIS P2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Zfp352-201ENSMUST00000080541 1656 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 1700101O22Rik-201ENSMUST00000187396 339 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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