Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Wdr11-201ENSMUST00000084519 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Cyld-203ENSMUST00000109626 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 1700027A15Rik-202ENSMUST00000188349 617 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Olfr484-202ENSMUST00000214722 4676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 AC164978.1-201ENSMUST00000228608 4011 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Sbno1-216ENSMUST00000199808 10161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Synpo2-207ENSMUST00000198584 9203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Fam198b-201ENSMUST00000029567 6627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Rassf6-201ENSMUST00000031317 1958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Glod4-206ENSMUST00000169701 4203 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprmP28828 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprmP28828 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
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PtprmP28828 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Pik3cg-202ENSMUST00000085469 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Olfr523-205ENSMUST00000215785 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Vmn1r44-212ENSMUST00000228183 1838 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Card6-201ENSMUST00000118365 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Naalad2-201ENSMUST00000001826 2831 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprmP28828 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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