Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 1700123O20Rik-203ENSMUST00000227269 893 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm6054-201ENSMUST00000078052 378 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Defa35-201ENSMUST00000078121 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm17199-201ENSMUST00000097296 416 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 AC166159.1-201ENSMUST00000227154 1380 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Adam2-201ENSMUST00000022618 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Synj2bp-204ENSMUST00000164431 3305 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Ube3c-204ENSMUST00000199032 3171 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Ankrd6-201ENSMUST00000035719 4683 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Nin-202ENSMUST00000085314 9675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr1346-202ENSMUST00000207658 4429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 AC112265.1-201ENSMUST00000213522 1501 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 3632451O06Rik-201ENSMUST00000036972 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Kyat3-201ENSMUST00000044392 4206 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Myt1-203ENSMUST00000108757 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Tcp10a-201ENSMUST00000095726 2442 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Kbtbd8-201ENSMUST00000032107 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm11809-201ENSMUST00000120923 950 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm13964-201ENSMUST00000133815 734 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm15843-201ENSMUST00000146593 529 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm5300-201ENSMUST00000182201 1003 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Mocs2-212ENSMUST00000184214 551 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm21923-201ENSMUST00000188455 696 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm26672-203ENSMUST00000192501 756 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm18131-201ENSMUST00000199241 449 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm40304-201ENSMUST00000202154 268 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 CT009733.1-202ENSMUST00000224941 441 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 CT009556.3-201ENSMUST00000226173 513 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms