Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Glce-203ENSMUST00000185675 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm42679-201ENSMUST00000197086 2906 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Srpk2-201ENSMUST00000088392 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Rian-209ENSMUST00000182406 3476 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Abcb11-204ENSMUST00000180142 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Vmn1r86-202ENSMUST00000226604 6378 ntAPPRIS P2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Tbx20-201ENSMUST00000052946 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm43507-202ENSMUST00000200281 2011 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms