Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm5654-201ENSMUST00000217787 475 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm5815-201ENSMUST00000050706 1185 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Rpl21-ps5-201ENSMUST00000095940 483 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Clip4-201ENSMUST00000024854 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Nr1i3-208ENSMUST00000155126 2980 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Mcm7-201ENSMUST00000000505 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Naa11-201ENSMUST00000060265 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Impa1-201ENSMUST00000065938 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Hdac4-202ENSMUST00000097644 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Ap3s2-201ENSMUST00000075657 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm17575-201ENSMUST00000180437 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Lilra5-201ENSMUST00000117550 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm18697-201ENSMUST00000191179 2126 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Map3k20-204ENSMUST00000135469 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Qrich2-204ENSMUST00000208602 7260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 AC125020.1-201ENSMUST00000220137 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Fam198b-201ENSMUST00000029567 6627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 6330549D23Rik-203ENSMUST00000160818 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 A330008L17Rik-201ENSMUST00000064349 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 4930407I10Rik-201ENSMUST00000100396 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Polr3a-201ENSMUST00000026322 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 4932413F04Rik-201ENSMUST00000190332 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 AC164437.4-204ENSMUST00000227169 4024 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Prim1P20664 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 A530041M06Rik-201ENSMUST00000199690 2288 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Prim1P20664 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Prim1P20664 AC122263.2-201ENSMUST00000145909 586 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Aste1-204ENSMUST00000167674 1227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Prim1P20664 Olfr32-206ENSMUST00000215765 1241 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Prim1P20664 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Olfr32-201ENSMUST00000099755 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Mical2-201ENSMUST00000037991 3352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Il10ra-201ENSMUST00000034594 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Uggt1-201ENSMUST00000046875 9033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Piwil4-203ENSMUST00000115644 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 AC166159.1-201ENSMUST00000227154 1380 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Tnni3k-201ENSMUST00000064076 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Myo1h-201ENSMUST00000124316 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Wee2-201ENSMUST00000038907 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm6356-201ENSMUST00000166618 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Paics-202ENSMUST00000117536 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Cdh16-201ENSMUST00000163783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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