Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm18410-201ENSMUST00000207199 577 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm33096-201ENSMUST00000210189 493 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 1700001C02Rik-201ENSMUST00000031078 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Olfr1408-201ENSMUST00000073663 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Mroh2b-201ENSMUST00000045736 4829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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PdgfaP20033 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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PdgfaP20033 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Ica1l-206ENSMUST00000191251 3415 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm14546-201ENSMUST00000138275 1647 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Serpina1d-201ENSMUST00000078869 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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PdgfaP20033 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm16434-201ENSMUST00000100888 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm6676-201ENSMUST00000166493 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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PdgfaP20033 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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PdgfaP20033 Gm14450-201ENSMUST00000119984 240 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm11688-201ENSMUST00000122145 308 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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PdgfaP20033 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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PdgfaP20033 A930031H19Rik-202ENSMUST00000153810 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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PdgfaP20033 AC122360.1-201ENSMUST00000217737 624 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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PdgfaP20033 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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PdgfaP20033 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms