Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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Ccl20O89093 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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Ccl20O89093 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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Ccl20O89093 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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Ccl20O89093 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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Ccl20O89093 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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Ccl20O89093 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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Ccl20O89093 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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Ccl20O89093 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms