Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Ighv13-2-202ENSMUST00000183954 302 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Lrrc51-203ENSMUST00000106963 835 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Tmsb4x-203ENSMUST00000112176 698 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm12499-201ENSMUST00000121961 546 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm26812-201ENSMUST00000181647 328 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Gm21060J3KMU4 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.1 ms