Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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Clrn2B2RVW2 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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Clrn2B2RVW2 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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Clrn2B2RVW2 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm5514-201ENSMUST00000060477 306 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Clrn2B2RVW2 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm42679-201ENSMUST00000197086 2906 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm37274-201ENSMUST00000192167 1682 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Zmynd11-205ENSMUST00000110636 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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