Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms