Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AgrnA2ASQ1 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AgrnA2ASQ1 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
AgrnA2ASQ1 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AgrnA2ASQ1 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
AgrnA2ASQ1 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
AgrnA2ASQ1 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
AgrnA2ASQ1 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
AgrnA2ASQ1 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
AgrnA2ASQ1 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
AgrnA2ASQ1 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
AgrnA2ASQ1 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
AgrnA2ASQ1 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AgrnA2ASQ1 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
AgrnA2ASQ1 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
AgrnA2ASQ1 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
AgrnA2ASQ1 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AgrnA2ASQ1 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AgrnA2ASQ1 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Ctnnd1-214ENSMUST00000111688 6146 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Sim1-201ENSMUST00000020071 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Atp2b4-203ENSMUST00000125659 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 AC129208.1-201ENSMUST00000227474 2906 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Kcnmb2-203ENSMUST00000178668 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Siah3-201ENSMUST00000164848 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Tbc1d8b-201ENSMUST00000096313 5094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm17167-201ENSMUST00000169242 5054 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Zkscan7-201ENSMUST00000063980 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Rlim-202ENSMUST00000121153 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Cdon-201ENSMUST00000042842 7213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Cflar-205ENSMUST00000114313 6572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
AgrnA2ASQ1 Slc17a6-201ENSMUST00000032710 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms