Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Ctnnd1-203ENSMUST00000067232 6119 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Tsc1-202ENSMUST00000113867 7682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Tsc1-201ENSMUST00000028155 7674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 4932431P20Rik-202ENSMUST00000141713 9288 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp180-201ENSMUST00000068975 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm973-201ENSMUST00000114243 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp652-202ENSMUST00000107717 10433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Agtpbp1-206ENSMUST00000164215 4331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Abca1-201ENSMUST00000030010 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Baz2a-208ENSMUST00000220049 8443 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rb1cc1Q9ESK9 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rb1cc1Q9ESK9 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rb1cc1Q9ESK9 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rb1cc1Q9ESK9 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rb1cc1Q9ESK9 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rb1cc1Q9ESK9 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Plekha6-202ENSMUST00000105082 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 C030034L19Rik-201ENSMUST00000180874 2032 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Nup155-201ENSMUST00000163765 6402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1261-203ENSMUST00000213909 2912 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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