Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Vmn2r-ps99-202ENSMUST00000223517 2338 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Rasef-202ENSMUST00000102837 5158 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Csde1-216ENSMUST00000199571 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Exd1-203ENSMUST00000171024 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Vmn2r-ps81-201ENSMUST00000172519 838 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm8896-201ENSMUST00000197434 1106 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm42767-201ENSMUST00000198583 632 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Setd5-203ENSMUST00000113157 6527 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Nif3l1-202ENSMUST00000114337 2168 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Vmn1r70-203ENSMUST00000226255 4868 ntAPPRIS P2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Dnajc6-201ENSMUST00000038207 5258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 CT009711.1-201ENSMUST00000223992 3040 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 A730049H05Rik-201ENSMUST00000057977 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Rgs4-202ENSMUST00000111357 2575 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 Gm45477-201ENSMUST00000200213 5498 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 Grin2a-206ENSMUST00000199708 14634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 Gm43766-201ENSMUST00000200590 5417 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 Gm8995-202ENSMUST00000208417 3490 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 Mx1-201ENSMUST00000023655 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 Kcnj15-201ENSMUST00000037154 5089 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 Arpp21-202ENSMUST00000070218 3181 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 Gm14399-205ENSMUST00000109062 626 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Smg9Q9DB90 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms