Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cldn22Q9D7U6 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cldn22Q9D7U6 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cldn22Q9D7U6 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cldn22Q9D7U6 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cldn22Q9D7U6 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cldn22Q9D7U6 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cldn22Q9D7U6 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cldn22Q9D7U6 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cldn22Q9D7U6 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cldn22Q9D7U6 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cldn22Q9D7U6 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cldn22Q9D7U6 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cldn22Q9D7U6 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cldn22Q9D7U6 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cldn22Q9D7U6 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cldn22Q9D7U6 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cldn22Q9D7U6 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cldn22Q9D7U6 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cldn22Q9D7U6 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cldn22Q9D7U6 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cldn22Q9D7U6 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cldn22Q9D7U6 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cldn22Q9D7U6 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cldn22Q9D7U6 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cldn22Q9D7U6 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cldn22Q9D7U6 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cldn22Q9D7U6 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cldn22Q9D7U6 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
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