Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
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