Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Olfr96-203ENSMUST00000214482 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Olfr76-203ENSMUST00000214676 3175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Top1mtQ8R4U6 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms