Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Itgb6-202ENSMUST00000059888 4806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Cflar-205ENSMUST00000114313 6572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Map1b-201ENSMUST00000064762 11808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Kcnk10-202ENSMUST00000221240 7460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Olfr551-202ENSMUST00000213540 5440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Yes1-202ENSMUST00000168707 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm5182-201ENSMUST00000217708 6092 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Rlim-202ENSMUST00000121153 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PtprdQ64487 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms