Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Tab3-201ENSMUST00000048250 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Olfr376-202ENSMUST00000120401 3342 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Ptprj-201ENSMUST00000111493 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Ncor1-201ENSMUST00000018645 9037 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Eya3-203ENSMUST00000081726 5160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Erg-202ENSMUST00000113846 3249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Ctsc-203ENSMUST00000131108 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Pax5-201ENSMUST00000014174 8004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Zfp292-202ENSMUST00000098163 9941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Srl-202ENSMUST00000090500 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Kif14-203ENSMUST00000189413 8943 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Pet2-201ENSMUST00000113959 4183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Pet2-202ENSMUST00000113960 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 4930471D02Rik-201ENSMUST00000180815 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Srcap-207ENSMUST00000187040 10654 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Nfasc-202ENSMUST00000094569 9739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Akap2-204ENSMUST00000102902 6993 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc18Q640L5 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms