Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PcolceQ61398 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms