Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 Gm17167-201ENSMUST00000169242 5054 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 Ddx6-201ENSMUST00000170489 6065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Psme4Q5SSW2 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Sdk2-201ENSMUST00000041627 11287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Fam160a1-202ENSMUST00000118408 4445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Nav1-202ENSMUST00000067414 13117 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Myh15-201ENSMUST00000168680 6340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Gm45861-201ENSMUST00000209669 7184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Phlpp2-203ENSMUST00000179721 7846 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Trim66-202ENSMUST00000106739 9250 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Klrc1-201ENSMUST00000032270 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Ppp1r7-201ENSMUST00000027494 10315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Mtmr4-203ENSMUST00000119628 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Dock9-206ENSMUST00000212181 7368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Med13l-202ENSMUST00000201010 7781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Ccdc180-204ENSMUST00000178561 5081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Olfr523-205ENSMUST00000215785 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Psme4Q5SSW2 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms