Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gpnmb-201ENSMUST00000031840 3701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Champ1-202ENSMUST00000128557 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Synj2-205ENSMUST00000115786 2531 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Pnmal1-201ENSMUST00000038163 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Eif2b3-202ENSMUST00000106447 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 AC153862.1-201ENSMUST00000215700 3349 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Enox2-203ENSMUST00000114912 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Prc1-210ENSMUST00000174172 3008 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Pign-210ENSMUST00000190811 3015 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Sez6l2-203ENSMUST00000106335 3732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Cass4-203ENSMUST00000109136 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm30414-201ENSMUST00000194886 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm45280-201ENSMUST00000210484 2552 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Snapc4-202ENSMUST00000114115 4368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm12059-201ENSMUST00000128996 3105 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Nolc1-209ENSMUST00000225780 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Tec-201ENSMUST00000071944 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 AC126028.1-201ENSMUST00000226218 2123 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Prdm1-204ENSMUST00000218369 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a5-ps-203ENSMUST00000223928 1442 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Ttc5-202ENSMUST00000226768 2366 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Ms4a6d-201ENSMUST00000025582 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Mss51-201ENSMUST00000022353 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm13879-201ENSMUST00000118308 242 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm12987-201ENSMUST00000118562 489 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm11537-201ENSMUST00000124865 791 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 1700125H03Rik-202ENSMUST00000139265 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Dnajc5b-204ENSMUST00000165693 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm10666-201ENSMUST00000098722 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r114-201ENSMUST00000098737 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Rpap2-203ENSMUST00000112651 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm15999-201ENSMUST00000127317 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gria3-209ENSMUST00000165288 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm44178-201ENSMUST00000205229 2930 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Tead1-206ENSMUST00000164363 1495 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 4136 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Sp100-210ENSMUST00000147552 1597 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Tnfsf8-201ENSMUST00000030047 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc55-202ENSMUST00000111601 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Afap1l2-202ENSMUST00000118800 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
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Lrrc43Q3V0L5 Gm29342-202ENSMUST00000189689 1500 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm29116-202ENSMUST00000189963 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm29081-203ENSMUST00000190140 1500 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm28726-201ENSMUST00000190994 1500 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm29386-203ENSMUST00000191185 1500 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm33954-202ENSMUST00000195188 1500 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Lpar1-202ENSMUST00000107570 3244 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Xpnpep3-201ENSMUST00000041609 3236 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm8688-201ENSMUST00000118240 969 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Hmgn2-ps1-201ENSMUST00000120716 279 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm12648-201ENSMUST00000126270 656 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm24083-201ENSMUST00000175174 120 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm10182-201ENSMUST00000178676 273 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Calm5-201ENSMUST00000183198 589 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Nxf1-205ENSMUST00000183939 1017 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms