Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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Rpusd3Q14AI6 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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Rpusd3Q14AI6 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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Rpusd3Q14AI6 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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Rpusd3Q14AI6 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
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Rpusd3Q14AI6 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
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Rpusd3Q14AI6 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
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Rpusd3Q14AI6 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
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Rpusd3Q14AI6 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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