Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms