Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Il6st-209ENSMUST00000184445 1870 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Ap1b1-202ENSMUST00000101613 3735 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Plekhs1-202ENSMUST00000178590 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Plekhs1-201ENSMUST00000039666 2378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Helz2-201ENSMUST00000094203 9162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gigyf2-217ENSMUST00000174501 3876 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Nol11-202ENSMUST00000106757 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm39164-202ENSMUST00000211519 236 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 AC154249.1-201ENSMUST00000226296 320 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gpihbp1-201ENSMUST00000023243 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Olfr1449-201ENSMUST00000056005 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Olfr45-201ENSMUST00000084454 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Tmem241-203ENSMUST00000092075 595 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Arid1b-203ENSMUST00000115799 9888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Ccnd2-201ENSMUST00000000188 6330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Trps1-205ENSMUST00000183997 3627 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Ccdc80-201ENSMUST00000061050 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Arhgef38-203ENSMUST00000161022 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Aldh3b3-202ENSMUST00000179433 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Nprl2-201ENSMUST00000010201 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Dnajc8-202ENSMUST00000094657 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Zfp169-207ENSMUST00000177530 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Usp28-203ENSMUST00000213874 4109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Cflar-201ENSMUST00000069333 3163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Mirg-204ENSMUST00000182185 3822 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm43280-201ENSMUST00000202958 1550 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Myo6-203ENSMUST00000113266 7632 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Fam110b-202ENSMUST00000108380 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Ndufs1-201ENSMUST00000027111 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Specc1l-202ENSMUST00000105421 6632 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Limk2-203ENSMUST00000101642 3693 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Arhgap28-203ENSMUST00000164647 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Rhbdd1-201ENSMUST00000027322 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm5883-201ENSMUST00000120735 495 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm12436-201ENSMUST00000131099 2959 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm12514-201ENSMUST00000142782 568 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm26182-201ENSMUST00000157688 116 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm3239-202ENSMUST00000169675 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm18828-201ENSMUST00000180475 857 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 C630050I24Rik-201ENSMUST00000193420 783 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm37198-201ENSMUST00000195593 2110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm44059-201ENSMUST00000204048 351 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Olfr503-202ENSMUST00000211693 966 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm10286-201ENSMUST00000093603 5077 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Olfr1261-203ENSMUST00000213909 2912 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Daam1-205ENSMUST00000223272 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Tcaf1-203ENSMUST00000121083 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Rbm12-202ENSMUST00000109604 6635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm14258-201ENSMUST00000144607 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm26562-201ENSMUST00000181113 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 4932438H23Rik-202ENSMUST00000114076 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 9130221F21Rik-201ENSMUST00000206867 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Ankdd1b-201ENSMUST00000055607 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm38123-201ENSMUST00000194990 2779 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 A330049N07Rik-203ENSMUST00000220010 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Calr4-203ENSMUST00000106629 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Trim12a-202ENSMUST00000106837 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Mgat4e-201ENSMUST00000052911 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Ddr2-201ENSMUST00000027985 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Ivl-201ENSMUST00000053107 1922 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms