Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Irx1P81068 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Irx1P81068 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Irx1P81068 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Irx1P81068 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Irx1P81068 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Irx1P81068 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Irx1P81068 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Irx1P81068 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 4220.6 ms