Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Anapc15-ps-201ENSMUST00000099328 426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm12253-201ENSMUST00000108825 1356 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Tmem27-202ENSMUST00000112280 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Slc25a5-ps-203ENSMUST00000223928 1442 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Tespa1-201ENSMUST00000042586 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm14036-201ENSMUST00000118248 480 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm8084-201ENSMUST00000120807 752 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm24063-201ENSMUST00000157491 105 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Scarna17-201ENSMUST00000158064 79 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm26980-201ENSMUST00000183321 395 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm6123-201ENSMUST00000193658 1069 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Tmigd3-206ENSMUST00000199977 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 4930557K07Rik-201ENSMUST00000205110 363 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC124712.1-201ENSMUST00000221833 445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm33682-201ENSMUST00000222233 256 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 E430024I08Rik-202ENSMUST00000220632 1513 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Tmem91-202ENSMUST00000108404 485 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 1700034H15Rik-205ENSMUST00000154116 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Fcor-201ENSMUST00000159364 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm21293-201ENSMUST00000170919 864 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VdrP48281 Nrg3os-201ENSMUST00000177141 927 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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