Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Slc2a2-201ENSMUST00000029240 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Rab11b-201ENSMUST00000057373 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Vmn1r51-204ENSMUST00000226977 4357 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Hivep2-205ENSMUST00000191138 9846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm10687-201ENSMUST00000180670 3233 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprkP35822 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprkP35822 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Depdc5-205ENSMUST00000120902 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Skp2-202ENSMUST00000110585 6185 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Adgrl3-205ENSMUST00000117985 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Adgrl3-212ENSMUST00000120144 4999 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprkP35822 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Erg-202ENSMUST00000113846 3249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprkP35822 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Olfr376-202ENSMUST00000120401 3342 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprkP35822 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprkP35822 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprkP35822 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprkP35822 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprkP35822 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprkP35822 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprkP35822 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprkP35822 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprkP35822 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprkP35822 Zfp827-202ENSMUST00000098614 7581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprkP35822 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprkP35822 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprkP35822 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprkP35822 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprkP35822 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprkP35822 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprkP35822 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprkP35822 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprkP35822 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprkP35822 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprkP35822 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprkP35822 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprkP35822 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprkP35822 Prpf8-202ENSMUST00000102510 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprkP35822 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprkP35822 Wdfy3-207ENSMUST00000212024 10539 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprkP35822 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprkP35822 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprkP35822 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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