Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Trbv14-201ENSMUST00000103272 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Mir6930-201ENSMUST00000183859 68 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm18349-201ENSMUST00000187440 904 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm6993-201ENSMUST00000219110 210 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Mir3072-201ENSMUST00000175610 83 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm21923-201ENSMUST00000188455 696 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm43013-201ENSMUST00000198216 247 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PrkcdP28867 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.2 ms