Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Tlk2-203ENSMUST00000106939 5494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Ttc28-201ENSMUST00000040111 10780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Nav2-202ENSMUST00000064395 11317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Ccdc141-207ENSMUST00000164114 6222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Daam1-205ENSMUST00000223272 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Tbc1d8b-201ENSMUST00000096313 5094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Patl2-201ENSMUST00000028665 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Stard13-202ENSMUST00000110483 5662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Vmn1r181-202ENSMUST00000226843 4496 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Ank3-231ENSMUST00000182884 9963 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Grk1-202ENSMUST00000209909 7431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Grk1-201ENSMUST00000033827 7425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Abca17-201ENSMUST00000039324 5202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 BC106179-201ENSMUST00000055369 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Frmd4b-204ENSMUST00000113359 4311 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Tecpr2-202ENSMUST00000169597 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Exoc5-207ENSMUST00000162175 12699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Olfr551-202ENSMUST00000213540 5440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 2900026A02Rik-202ENSMUST00000211733 10238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Inpp5d-211ENSMUST00000170300 3942 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm43679-201ENSMUST00000197051 3677 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Slco5a1-207ENSMUST00000188454 8463 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
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