Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Fbxl12-210ENSMUST00000155301 476 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps75-201ENSMUST00000173251 213 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm26812-201ENSMUST00000181647 328 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm29273-201ENSMUST00000188880 262 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 2610034O05Rik-201ENSMUST00000194078 855 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm44245-201ENSMUST00000204304 232 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 AC153971.2-201ENSMUST00000214553 777 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm46124-202ENSMUST00000217260 860 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 AC139569.1-201ENSMUST00000226080 614 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gng2-201ENSMUST00000055100 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Naip1-202ENSMUST00000221727 1968 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Ano3-201ENSMUST00000099623 6705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm28497-201ENSMUST00000189646 3029 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Sh3d19-203ENSMUST00000182666 6886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Erp44-201ENSMUST00000030028 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Mmp27-201ENSMUST00000120900 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Phc3-210ENSMUST00000177992 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Crisp2-201ENSMUST00000024724 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm45194-202ENSMUST00000207962 1991 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Zfyve9-201ENSMUST00000042185 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 n-R5s1-201ENSMUST00000101925 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm23942-201ENSMUST00000101956 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm22660-201ENSMUST00000104193 130 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Spata48-202ENSMUST00000109678 753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm12344-201ENSMUST00000117087 329 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm14725-201ENSMUST00000120324 828 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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Hoxd9P28357 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm13923-201ENSMUST00000153283 288 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Cd180-202ENSMUST00000167144 430 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr760-ps1-201ENSMUST00000172563 748 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps122-201ENSMUST00000176687 906 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm28980-201ENSMUST00000187877 219 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 1700030F04Rik-202ENSMUST00000188781 617 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm28239-201ENSMUST00000190225 447 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 D130017N08Rik-204ENSMUST00000199836 506 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm44448-201ENSMUST00000205104 393 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm45145-203ENSMUST00000208872 958 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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