Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm37262-201ENSMUST00000192816 1818 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Rassf6-201ENSMUST00000031317 1958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Plec-218ENSMUST00000169714 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Plec-201ENSMUST00000023226 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 C8a-203ENSMUST00000106808 3539 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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